Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nrif1Q923B3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nrif1Q923B3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nrif1Q923B3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrif1Q923B3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Nrif1Q923B3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrif1Q923B3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms