Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snx18Q91ZR2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx18Q91ZR2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms