Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc5a4bQ91ZP4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc5a4bQ91ZP4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms