Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z40

Gbp7, Gbp6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp7Q91Z40 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp7Q91Z40 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp7Q91Z40 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp7Q91Z40 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp7Q91Z40 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp7Q91Z40 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp7Q91Z40 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp7Q91Z40 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp7Q91Z40 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gbp7Q91Z40 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp7Q91Z40 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms