Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx9Q91VH2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx9Q91VH2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms