Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCA5

Tmprss4, Transmembrane protease serine 4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss4Q8VCA5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmprss4Q8VCA5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmprss4Q8VCA5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmprss4Q8VCA5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms