Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Z5

Cacnb1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb1Q8R3Z5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb1Q8R3Z5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb1Q8R3Z5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb1Q8R3Z5 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb1Q8R3Z5 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacnb1Q8R3Z5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacnb1Q8R3Z5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacnb1Q8R3Z5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb1Q8R3Z5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb1Q8R3Z5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb1Q8R3Z5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb1Q8R3Z5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms