Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brf1Q8CFK2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brf1Q8CFK2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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