Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CF25 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CF25 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CF25 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CF25 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CF25 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CF25 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CF25 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CF25 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CF25 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CF25 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CF25 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CF25 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CF25 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CF25 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CF25 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CF25 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CF25 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CF25 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CF25 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CF25 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CF25 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CF25 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CF25 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CF25 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CF25 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CF25 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CF25 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CF25 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CF25 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CF25 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CF25 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CF25 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CF25 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CF25 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms