Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc87Q8CDL9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms