Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4aQ8C9S8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4aQ8C9S8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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