Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amigo3Q8C2S7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amigo3Q8C2S7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Amigo3Q8C2S7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Amigo3Q8C2S7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
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