Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmod1Q8BVA4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms