Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW9

Chtf18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, mousemouse

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Length 969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chtf18Q8BIW9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chtf18Q8BIW9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chtf18Q8BIW9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms