Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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