Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcsk9Q80W65 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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Pcsk9Q80W65 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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