Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyfip1Q7TMB8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms