Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnip4Q6PHZ8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip4Q6PHZ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms