Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD26

Pigs, GPI transamidase component PIG-S, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigsQ6PD26 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PigsQ6PD26 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PigsQ6PD26 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms