Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NesQ6P5H2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NesQ6P5H2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NesQ6P5H2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms