Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg9bQ6EBV9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms