Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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