Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga3Q62470 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga3Q62470 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms