Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa13Q62424 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa13Q62424 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa13Q62424 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms