Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff3Q62395 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff3Q62395 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms