Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sycp1Q62209 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms