Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctr9Q62018 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctr9Q62018 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms