Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1aQ61495 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dsg1aQ61495 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg1aQ61495 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms