Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a1Q61165 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms