Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samhd1Q60710 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Samhd1Q60710 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms