Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ItgaeQ60677 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ItgaeQ60677 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms