Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp13a3Q5XF89 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a3Q5XF89 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.5 ms