Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf215Q5SPX3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf215Q5SPX3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf215Q5SPX3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms