Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d4Q5RJF7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms