Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrfip1Q3UZ39 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms