Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B3gnt6Q3USF0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B3gnt6Q3USF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B3gnt6Q3USF0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms