Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf48Q3US17 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms