Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cln5Q3UMW8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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