Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spg7Q3ULF4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spg7Q3ULF4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spg7Q3ULF4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms