Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc2Q3ULD5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc2Q3ULD5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 583.7 ms