Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Serac1Q3U213 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serac1Q3U213 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms