Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb38Q3LR78 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb38Q3LR78 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb38Q3LR78 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb38Q3LR78 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb38Q3LR78 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb38Q3LR78 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zbtb38Q3LR78 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbtb38Q3LR78 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb38Q3LR78 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb38Q3LR78 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb38Q3LR78 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb38Q3LR78 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbtb38Q3LR78 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb38Q3LR78 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb38Q3LR78 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbtb38Q3LR78 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms