Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp2b3Q0VF55 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b3Q0VF55 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms