Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnn1Q08091 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn1Q08091 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms