Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Thbs3Q05895 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms