Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCQQ04759 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms