Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Muc1Q02496 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Muc1Q02496 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Muc1Q02496 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms