Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VcpQ01853 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VcpQ01853 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VcpQ01853 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VcpQ01853 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VcpQ01853 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VcpQ01853 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VcpQ01853 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VcpQ01853 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VcpQ01853 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VcpQ01853 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VcpQ01853 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms