Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabpaQ00422 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GabpaQ00422 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms