Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smyd1P97443 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smyd1P97443 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd1P97443 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms